Revisitando... o projeto Durante o Hack o foco foi apenas em imagens do pulmão, agora extendido para outros orgãos
Arquivos de Código para DULI - Versão 09/2024
- README.md # Nome do Arquivo: README.md # Data: 09/09/2024 # Responsável: Zeh Sobrinho # Assinatura: ________________________
DULI - Detector Universal de Lesões por Imagens
Descrição:
O DULI é uma plataforma de Inteligência Artificial desenvolvida para auxiliar no diagnóstico médico de patologias respiratórias e outras doenças, como COVID-19, SARS, pneumonias, e outras patologias graves. Utilizando técnicas avançadas de Deep Learning, o DULI é treinado com uma ampla variedade de datasets para identificar doenças através de imagens de raio-X, tomografia computadorizada (TC), e outros inputs médicos, como sangue e ECG.
Objetivos:
- Desenvolver um sistema que seja capaz de classificar imagens médicas com precisão e sugerir possíveis diagnósticos de doenças.
- Garantir que o sistema seja acessível, não invasivo, simples e barato.
- Expandir a capacidade de diagnóstico para incluir diferentes órgãos além do pulmão, como rins, coração e cérebro.
Funcionalidades Principais:
- Classificação de patologias respiratórias, cardiovasculares e outras, a partir de imagens de raio-X, TC, e exames de sangue.
- Exibição de áreas afetadas por doenças através de máscaras 2D e 3D nas imagens.
- Acurácia dos diagnósticos com base no tipo de dataset e patologia.
Estrutura do Projeto:
├── /datasets # Contém datasets de diversas patologias
│ ├── /covid19/ # Imagens e dados de COVID-19
│ │ ├── /lungs/ # Dataset focado no pulmão
│ │ │ ├── /ARDS/ # Imagens de Síndrome do Desconforto Respiratório Agudo (ARDS)
│ │ │ ├── /pneumonia/ # Imagens de COVID-19 com pneumonia
│ │ │ ├── /tomografia_comp/ # Tomografias computadorizadas de COVID-19
│ │ │ └── /normal/ # Imagens de pulmão normal
│ │ ├── /blood/ # Dataset com dados de sangue
│ │ ├── /kidneys/ # Dataset com foco em rins
│ │ ├── /brain/ # Dataset com foco no cérebro
│ │ └── /ct_scans/ # Tomografias Computadorizadas de COVID-19
│ ├── /sars/ # Dataset SARS
│ │ └── /lungs/ # Imagens de Raio-X e TC de SARS
│ ├── /pneumonia/ # Diversos tipos de pneumonia
│ │ ├── /aspiracao/ # Pneumonia por aspiração
│ │ ├── /cavitante/ # Pneumonia cavitante
│ │ ├── /klebsiella/ # Pneumonia por Klebsiella
│ │ ├── /pneumococcal/ # Pneumonia pneumocócica
│ │ ├── /pneumocystis/ # Pneumonia por Pneumocystis (inclui jirovecii e carinii)
│ │ ├── /legionella/ # Pneumonia legionella
│ │ └── /streptococcus/ # Pneumonia Streptococcus
│ ├── /pneumocystis/ # Dataset específico para Pneumocystis
│ │ └── /lungs/ # Imagens de Raio-X e TC de Pneumocystis
│ ├── /legionella/ # Dataset específico para Legionella
│ │ └── /lungs/ # Imagens de Raio-X e TC de Legionella
│ └── /streptococcus/ # Dataset específico para Streptococcus
│ │ └── /lungs/ # Imagens de Raio-X e TC de Streptococcus
├── /models # Modelos treinados
│ ├── duli_lungs_v1.h5 # Modelo focado em pulmões
│ ├── duli_blood_v1.h5 # Modelo focado em sangue
│ └── duli_multi_v1.h5 # Modelo multifuncional para diferentes órgãos
├── /scripts # Scripts para treinamento e teste
│ ├── train_duli_lungs.py # Treinamento focado em pulmões
│ ├── train_duli_blood.py # Treinamento focado em sangue
│ ├── test_duli.py # Teste geral dos modelos
├── /results # Resultados de testes
│ └── accuracy_report_v1.txt # Relatório de acurácia de todas as versões
├── /docs # Documentação técnica
│ ├── README.md # Documentação geral do projeto
│ └── versioning.md # Histórico de versões
├── /ux_ui # Prototipação de UX/UI
│ └── /mobile_app/ # Protótipos da aplicação móvel
└── /test # Testes e avaliação do modelo
Use code with caution.
Bash
Datasets:
COVID-19:
Pulmão (Raio-X e TC):
IEEE 8023/covid-chestxray-dataset: https://github.com/ieee8023/covid-chestxray-dataset
COVID-Net Open Source Initiative: https://github.com/lindawangg/COVID-Net
COVID-CT-Dataset: https://github.com/UCSD-AI4H/COVID-CT-Dataset
National Institutes of Health: https://www.nih.gov/ - Procure por estudos específicos de imagem médica para COVID-19.
Datasets do Ministério da Saúde do Brasil: (buscar por dados de imagem e biomarcadores)
Sangue:
COVID-19 Global Forecasting Project: https://www.kaggle.com/c/covid19-global-forecasting
Rins:
The Kidney Image Segmentation Challenge (KiTS): https://kits19.grand-challenge.org/
PubMed: https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/ - Use palavras-chave como "COVID-19" e "kidney imaging" para encontrar estudos relacionados.
Cérebro:
The COVID-19 Brain Research Initiative: https://www.nih.gov/news-events/news-releases/nih-launches-covid-19-brain-research-initiative - Procure por estudos específicos de imagem cerebral.
Open Access Series of Imaging Studies (OASIS): https://www.oasis-brains.org/
Pneumonia:
National Institutes of Health: https://www.nih.gov/ - Procure por estudos específicos de imagem médica para diferentes tipos de pneumonia.
JHU CSSE COVID-19 Data set: https://github.com/CSSEGISandData/COVID-19
Radiopaedia: https://radiopaedia.org/
SARS:
National Institutes of Health: https://www.nih.gov/ - Procure por estudos específicos de imagem médica para SARS.
JHU SARS Dataset: https://github.com/CSSEGISandData/SARS
WHO SARS Data: https://www.who.int/csr/sars/en/
Documentação:
Este README.md serve como documentação geral do projeto DULI, descrevendo seus objetivos, funcionalidades, estrutura, datasets e próximos passos.
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